MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497348
2	NC_000954	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497348
3	NC_000954	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
4	NC_000954	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
5	NC_000954	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
6	NC_000954	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
7	NC_000954	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
8	NC_000954	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
9	NC_000954	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497348
10	NC_000954	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497348
11	NC_000954	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
12	NC_000954	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
13	NC_000954	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
14	NC_000954	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497348
15	NC_000954	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
16	NC_000954	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
17	NC_000954	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
18	NC_000954	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
19	NC_000954	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
20	NC_000954	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
21	NC_000954	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497348
22	NC_000954	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
23	NC_000954	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
24	NC_000954	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497348
25	NC_000954	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
26	NC_000954	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
27	NC_000954	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
28	NC_000954	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
29	NC_000954	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497349
30	NC_000954	AGCA	2	8	1427	1434	50 %	0 %	25 %	25 %	11497349
31	NC_000954	AG	3	6	1509	1514	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
32	NC_000954	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497349
33	NC_000954	AGG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497349
34	NC_000954	TTGC	2	8	1615	1622	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
35	NC_000954	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
36	NC_000954	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
37	NC_000954	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	11497349
38	NC_000954	TCT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497349
39	NC_000954	TTG	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497349
40	NC_000954	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
41	NC_000954	GA	3	6	1861	1866	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
42	NC_000954	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497350
43	NC_000954	A	6	6	2052	2057	100 %	0 %	0 %	0 %	11497350
44	NC_000954	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497350
45	NC_000954	ACA	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497350
46	NC_000954	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497350
47	NC_000954	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	11497350
48	NC_000954	TGCT	2	8	2536	2543	0 %	50 %	25 %	25 %	11497350
49	NC_000954	AATTA	2	10	2574	2583	60 %	40 %	0 %	0 %	11497350
50	NC_000954	CAAG	2	8	2685	2692	50 %	0 %	25 %	25 %	11497351
51	NC_000954	GAA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
52	NC_000954	A	6	6	2769	2774	100 %	0 %	0 %	0 %	11497351
53	NC_000954	TAG	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
54	NC_000954	GTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497351
55	NC_000954	AGA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
56	NC_000954	TA	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	11497351
57	NC_000954	CTGATA	2	12	2992	3003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497351
58	NC_000954	ATGT	2	8	3022	3029	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
59	NC_000954	TAG	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
60	NC_000954	GTAT	2	8	3047	3054	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
61	NC_000954	ATAA	2	8	3129	3136	75 %	25 %	0 %	0 %	11497351
62	NC_000954	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497351
63	NC_000954	TGG	3	9	3158	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
64	NC_000954	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497351
65	NC_000954	CT	3	6	3195	3200	0 %	50 %	0 %	50 %	11497351
66	NC_000954	CAAT	2	8	3211	3218	50 %	25 %	0 %	25 %	11497351
67	NC_000954	ATCAAG	2	12	3238	3249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497351
68	NC_000954	TGG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
69	NC_000954	A	7	7	4968	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	11497326
70	NC_000954	GAA	3	9	4997	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
71	NC_000954	TTAC	2	8	5165	5172	25 %	50 %	0 %	25 %	11497326
72	NC_000954	GTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497326
73	NC_000954	GAATTT	2	12	5219	5230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497326
74	NC_000954	A	6	6	5240	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	11497326
75	NC_000954	TGAACT	2	12	5257	5268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497326
76	NC_000954	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497326
77	NC_000954	TAG	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497326
78	NC_000954	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
79	NC_000954	G	6	6	5311	5316	0 %	0 %	100 %	0 %	11497326
80	NC_000954	TG	3	6	5396	5401	0 %	50 %	50 %	0 %	11497326
81	NC_000954	AATG	2	8	5412	5419	50 %	25 %	25 %	0 %	11497326
82	NC_000954	TGT	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556547
83	NC_000954	TTC	2	6	5526	5531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556547
84	NC_000954	AG	3	6	5537	5542	50 %	0 %	50 %	0 %	364556547
85	NC_000954	TTA	2	6	5579	5584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556547
86	NC_000954	TGG	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497328
87	NC_000954	TAG	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497328
88	NC_000954	AT	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
89	NC_000954	AAT	2	6	5937	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497328
90	NC_000954	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
91	NC_000954	CTA	2	6	6030	6035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497328
92	NC_000954	AAGT	2	8	6077	6084	50 %	25 %	25 %	0 %	11497328
93	NC_000954	GCA	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497328
94	NC_000954	TTG	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497328
95	NC_000954	AAT	2	6	6245	6250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
96	NC_000954	ATC	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497329
97	NC_000954	GCT	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497329
98	NC_000954	ATA	2	6	6320	6325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
99	NC_000954	AT	4	8	6422	6429	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
100	NC_000954	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
101	NC_000954	TAA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
102	NC_000954	AGG	2	6	6702	6707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497329
103	NC_000954	TGG	2	6	7883	7888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497353
104	NC_000954	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
105	NC_000954	TAG	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497353
106	NC_000954	TAA	2	6	7975	7980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497353
107	NC_000954	TGA	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497353
108	NC_000954	ACA	2	6	8083	8088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
109	NC_000954	ATT	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497353
110	NC_000954	AAG	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497353
111	NC_000954	CTG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497353
112	NC_000954	A	6	6	8248	8253	100 %	0 %	0 %	0 %	11497353
113	NC_000954	ACA	2	6	8263	8268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
114	NC_000954	TGA	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497354
115	NC_000954	A	7	7	8798	8804	100 %	0 %	0 %	0 %	11497354
116	NC_000954	CTTG	2	8	8813	8820	0 %	50 %	25 %	25 %	11497354
117	NC_000954	TAC	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497354
118	NC_000954	A	6	6	8886	8891	100 %	0 %	0 %	0 %	11497354
119	NC_000954	AATT	2	8	8959	8966	50 %	50 %	0 %	0 %	11497354
120	NC_000954	TGC	2	6	9030	9035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497355
121	NC_000954	A	6	6	9039	9044	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
122	NC_000954	A	6	6	9091	9096	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
123	NC_000954	A	6	6	9126	9131	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
124	NC_000954	A	6	6	9148	9153	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
125	NC_000954	TAG	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497355
126	NC_000954	AG	3	6	9187	9192	50 %	0 %	50 %	0 %	11497355
127	NC_000954	A	6	6	9223	9228	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
128	NC_000954	AGA	2	6	9277	9282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
129	NC_000954	TTG	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497355
130	NC_000954	GGA	2	6	9451	9456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497355
131	NC_000954	A	6	6	9475	9480	100 %	0 %	0 %	0 %	11497355
132	NC_000954	GAA	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
133	NC_000954	CAAAA	2	10	9498	9507	80 %	0 %	0 %	20 %	11497355
134	NC_000954	AG	3	6	9555	9560	50 %	0 %	50 %	0 %	11497355
135	NC_000954	ATT	2	6	9571	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497355
136	NC_000954	AGA	2	6	9612	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
137	NC_000954	CAAG	2	8	9628	9635	50 %	0 %	25 %	25 %	11497355
138	NC_000954	GTG	2	6	9725	9730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497355
139	NC_000954	AGC	2	6	9736	9741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497355
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